复杂推理模型从服务器移植到Web浏览器的理论和实战
一 背景
随着机器学习的应用面越来越广,能在浏览器中跑模型推理的 Javascript 框架引擎也越来越多了。在项目中,前端同学可能会找到一些跑在服务端的 python 算法模型,很想将其直接集成到自己的代码中,以 Javascript 语言在浏览器中运行。
对于一部分简单的模型,推理的前处理、后处理比较容易,不涉及复杂的科学计算,碰到这种模型,最多做个模型格式转化,然后用推理框架直接跑就可以了,这种移植成本很低。
而很大一部分模型会涉及复杂的前处理、后处理,包括大量的矩阵运算、图像处理等 Python 代码。这种情况一般的思路就是用 Javascript 语言将 Python 代码手工翻译一遍,这么做的问题是费时费力还容易出错。
Pyodide 作为浏览器中的科学计算框架,很好的解决了这个问题:浏览器中运行原生的 Python 代码进行前、后处理,大量 numpy、scipy 的矩阵、张量等计算无需翻译为 Javascript,为移植节省了很多工作。本文就基于 pyodide 框架,从理论和实战两个角度,帮助前端同学解决复杂模型的移植这一棘手问题。
二 原理篇
Pyodide 是个可以在浏览器中跑的 WebAssembly(wasm)应用。它基于 CPython 的源代码进行了扩展,使用 emscripten 编译成为 wasm,同时也把一大堆科学计算相关的 pypi 包也编译成了 wasm,这样就能在浏览器中解释执行 python 语句进行科学计算了。所以 pyodide 也必然遵循 wasm 的各种约束。Pyodide 在浏览器中的位置如下图所示:
1 wasm 内存布局
这是 wasm 线性内存的布局:
Data 数据段是从 0x400 开始的, Function Table 表也在其中,起始地址为 memoryBase(Emscripten 中默认为 1024,即 0x400),STACKTOP 为栈地址起始,堆地址起始为 STACK_MAX。而我们实际更关心的是 Javascript 内存与 wasm 内存的互相访问。
2 Javascript 与 Python 的互访
浏览器基于安全方面的考虑,防止 wasm 程序把浏览器搞崩溃,通过把 wasm 运行在一个沙箱化的执行环境中,禁止了 wasm 程序访问 Javascript 内存,而 Javascript 代码却可以访问 wasm 内存。因为 wasm 内存本质上是一个巨大的 ArrayBuffer,接受 Javascript 的管理。我们称之为 “单向内存访问”。
作为一个 wasm 格式的普通程序,pyodide 被调用起来后,当然只能直接访问 wasm 内存。
为了实现互访,pyodide 引入了 proxy,类似于指针:在 Javascript 侧,通过一个 PyProxy 对象来引用 python 内存里的对象;在 Python 侧,通过一个 JsProxy 对象来引用 Javascript 内存里的对象。
在 Javascript 侧生成一个 PyProxy 对象:
const arr_pyproxy = pyodide.globals.get('arr') // arr是python里的一个全局对象
在 Python 侧生成一个 JsProxy 对象:
import js
from js import foo # foo是Javascript里的一个全局对象
互访时的类型转换分为如下三个等级:
-
【自动转换】对于简单类型,如数字、字符串、布尔等,会被自动拷贝内存值,此时产生的就不是 Proxy、而是最终的值了。
-
【半自动转换】非简单的内置类型,都需要通过 to_js()、to_py() 方式来显式转换:
-
对于 Python 内置的 list、dict、numpy.ndarray 等对象,不属于简单类型,不会自动转换类型,必须通过 pyodide.to_js() 来转,相应的会被转成 JS 的 list、map、TypedArray 类型
-
反过来也类似,通过 to_py() 方法,JS 的 TypedArray 转为 memoryview,list、map 转为 list、dict
-
【手动转换】各种 class、function 和用户自定义类型,因为对方的语言没有对应的现成类型,所以只能以 proxy 的形式存在,需要通过运算符来间接操纵,就像操纵提线木偶一样。为了达到方便操纵的目的,pyodide 对两种语言进行了语法模拟,用一种语言里的操作符模拟另一种语言的类似行为。例如:JS 中的 let a=new XXX(),在 Python 中就变为 a=XXX.new()。
这里列举了一部分,详情可以查文档(见文章底部)。
Javascript 的模块也可以引入到 Python 中,这样 Python 就能直接调用该模块的接口和方法了。例如,pyodide 没有编译 opencv 包,可以使用 opencv.js:
import pyodide
import js.cv as cv2
print(dir(cv2))
这对于 pyodide 缺失的 pypi 包是个很好的补充。
三 实践篇
我们从一个空白页面开始。使用浏览器打开测试页面(测试页面见文章底部)。
1 初始化 python
为了方便观察运行过程,使用动态的方式加载所需 js 和执行 python 代码。打开浏览器控制台,依次运行以下语句:
function loadJS( url, callback ){
var script = document.createElement('script'),
fn = callback || function(){};
script.type = 'text/javascript';
script.onload = function(){
fn();
};
script.src = url;
document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild(script);
}
// 加载opencv
loadJS('https://test-bucket-duplicate.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/public/opencv/opencv.js', function(){
console.log('js load ok');
});
// 加载推理引擎onnxruntime.js。当然也可以使用其他推理引擎
loadJS('https://test-bucket-duplicate.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/public/onnxruntime/onnx.min.js', function(){
console.log('js load ok');
});
// 初始化python运行环境
loadJS('https://test-bucket-duplicate.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/public/pyodide/0.18.0/pyodide.js', function(){
console.log('js load ok');
});
pyodide = await loadPyodide({ indexURL : "https://test-bucket-duplicate.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/public/pyodide/0.18.0/"});
await pyodide.loadPackage(['micropip']);
至此,python 和 pip 就安装完毕了,都位于内存文件系统中。我们可以查看一下 python 被安装到了哪里:
注意,这个文件系统是内存里虚拟出来的,刷新页面就丢失了。不过由于浏览器本身有缓存,所以刷新页面后从服务端再次加载 pyodide 的引导 js 和主体 wasm 还是比较快的,只要不清理浏览器缓存。
2 加载 pypi 包
在 pyodide 初始化完成后,python 系统自带的标准模块可以直接 import。第三方模块需要用 micropip.install() 安装:
- pypi.org 上的纯 python 包可以用 micropip.install() 直接安装
- 含有 C 语言扩展(编译为动态链接库)的 wheel 包,需要对照官方已编译包的列表
- 在列表中的直接用 micropip.install() 安装
- 不在这个列表里的,就需要自己手动编译后发布到服务器后再用 micropip.install() 安装。
下图展示了业内常用的两种编译为 wasm 的方式。
自己编译 wasm package 的方法可参考官方手册,大致步骤就是 pull 官方的编译基础镜像,把待编译包的 setup.cfg 文件放到模块目录里,再加上些 hack 的语句和配置(如果有的话),然后指定目标进行编译。编译成功后部署时,需要注意 2 点:
-
设置允许跨域
-
对于 wasm 格式的文件请求,响应 Header 里应当带上:"Content-type": "application/wasm"
下面是一个自建 wasm 服务器的 nginx/openresty 示例配置:
location ~ ^/wasm/ {
add_header 'Access-Control-Allow-Origin' "*";
add_header 'Access-Control-Allow-Credentials' "true";
root /path/to/wasm_dir;
header_filter_by_lua '
uri = ngx.var.uri
if string.match(uri, ".js$") == nil then
ngx.header["Content-type"] = "application/wasm"
end
';
}
回到我们的推理实例, 现在用 pip 安装模型推理所需的 numpy 和 Pillow 包并将其 import:
await pyodide.runPythonAsync(`
import micropip
micropip.install(["numpy", "Pillow"])
`);
await pyodide.runPythonAsync(`
import pyodide
import js.cv as cv2
import js.onnx as onnxruntime
import numpy as np
`);
这样 python 所需的 opencv、onnxruntime 包就已全部导入了。
3 opencv 的使用
一般 python 里的图片数组都是从 JS 里传过来的,这里我们模拟构造一张图片,然后用 opencv 对其 resize。上面提到过,pyodide 官方的 opencv 还没编译出来。如果涉及到的 opencv 方法调用有其他 pypi 包的替代品,那是最好的:比如,cv.resize 可以用 Pillow 库的 PIL.resize 代替(注意 Pillow 的 resize 速度比 opencv 的 resize 要慢);cv.threshold 可以用 numpy.where 代替。 否则只能调用 opencv.js 的能力了。为了演示 pyodide 语法,这里都从 opencv.js 库里调用。
await pyodide.runPythonAsync(`
# 构造一个1080p图片
h,w = 1080,1920
img = np.arange(h * w * 3, dtype=np.uint8).reshape(h, w, 3)
# 使用cv2.resize将其缩小为1/10
# 原python代码:small_img = cv2.resize(img, (h_small, w_small))
# 改成调用opencv.js:
h_small,w_small = 108, 192
mat = cv2.matFromArray(h, w, cv2.CV_8UC3, pyodide.to_js(img.reshape(h * w * 3)))
dst = cv2.Mat.new(h_small, w_small, cv2.CV_8UC3)
cv2.resize(mat, dst, cv2.Size.new(w_small, h_small), 0, 0, cv2.INTER_NEAREST)
small_img = np.asarray(dst.data.to_py()).reshape(h_small, w_small, 3)
`);
传参原则:除了简单的数字、字符串类型可以直接传,其他类型都需要通过 pyodide.to_js() 转换后再传入。 返回值的获取也类似,除了简单的数字、字符串类型可以直接获取,其他类型都需要通过 xx.to_py() 转换后获取结果。
接着对一个 mask 检测其轮廓:
await pyodide.runPythonAsync(`
# 使用cv2.findContours来检测轮廓。假设mask为二维numpy数组,只有0、1两个值
# 原python代码:contours = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_CCOMP,cv2.CHAIN_APPROX_NONE)
# 改成调用opencv.js:
contours_jsproxy = cv2.MatVector.new() # cv2.Mat数组,对应opencv.js中的 contours = new cv.MatVector()语句
hierarchy_jsproxy = cv2.Mat.new()
mat = cv2.matFromArray(mask.shape[0], mask.shape[1], cv2.CV_8UC1, pyodide.to_js(mask.reshape(mask.size)))
cv2.findContours(mat, pyodide.to_js(contours_jsproxy), pyodide.to_js(hierarchy_jsproxy), cv2.RETR_LIST, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
# contours js格式转python格式
contours = []
for i in range(contours_jsproxy.size()):
c_jsproxy = contours_jsproxy.get(i)
c = np.asarray(c_jsproxy.data32S.to_py()).reshape(c_jsproxy.rows, c_jsproxy.cols, 2)
contours.append(c)
`);
4 推理引擎的使用
最后,用 onnx.js 加载模型并进行推理,详细语法可参考 onnx.js 官方文档。其他 js 版的推理引擎也都可以参考各自的文档。
await pyodide.runPythonAsync(`
model_url="onnx模型的地址"
session = onnxruntime.InferenceSession.new()
session.loadModel(model_url)
session.run(......)
`);
通过以上的操作,我们确保了一切都在 python 语法范围内进行,这样修改原始的 Python 文件就比较容易了:把不支持的函数替换成我们自定义的调用 js 的方法;原 Python 里的推理替换成调用 js 版的推理引擎;最后在 Javascript 主程序框架里加少许调用 Python 的胶水代码就完成了。
5 挂载持久存储文件系统
有时我们需要对一些数据持久保存,可以利用 pyodide 提供的持久化文件系统(其实是 emscripten 提供的),见手册(文章底部)。
// 创建挂载点
pyodide.FS.mkdir('/mnt');
// 挂载文件系统
pyodide.FS.mount(pyodide.FS.filesystems.IDBFS, {}, '/mnt');
// 写入一个文件
pyodide.FS.writeFile('/mnt/test.txt', 'hello world');
// 真正的保存文件到持久文件系统
pyodide.FS.syncfs(function (err) {
console.log(err);
});
这样文件就持久保存了。即使当我们刷新页面后,仍可以通过挂载该文件系统来读出里面的内容:
// 创建挂载点
pyodide.FS.mkdir('/mnt');
// 挂载文件系统
pyodide.FS.mount(pyodide.FS.filesystems.IDBFS, {}, '/mnt');
// 写入一个文件
pyodide.FS.writeFile('/mnt/test.txt', 'hello world');
// 真正的保存文件到持久文件系统
pyodide.FS.syncfs(function (err) {
console.log(err);
});
运行结果如下:
当然,以上语句可以在 python 中以 Proxy 的语法方式运行。
持久文件系统有很多用处。例如,可以帮我们在多线程(webworker)之间共享大数据;可以把模型文件持久存储到文件系统里,无需每次都通过网络加载。
6 打 wheel 包
单 Python 文件无需打包,直接当成一个巨大的字符串,交给 pyodide.runPythonAsync() 运行就好了。当有多个 Python 文件时,我们可以把这些 python 文件打成普通 wheel 包,部署到 webserver,然后可以用 micropip 直接安装该 wheel 包:
micropip.install("https://foo.com/bar-1.2.3-xxx.whl")
from bar import ...
注意,打 wheel 包需要有__init__.py 文件,哪怕是个空文件。
四 存在的缺陷
目前 pyodide 有如下几个缺陷:
-
Python 运行环境加载和初始化时间有点儿长,视网络情况,几秒到几十秒都有可能。
-
pypi 包支持的不完整。虽然 pypi.org 上的纯 python 包都可以直接使用,但涉及到 C 扩展写的包,如果官方还没编译出来,那就需要自己动手编译了。
-
个别很常用的包,例如 opencv,还没成功编译出来;模型推理框架一个都没有。不过还好可以通过相应的 JS 库来弥补。
-
如果 python 中调用了 js 库的话:
-
可能会产生一定的内存拷贝开销(从 wasm 内存到 JS 内存的来回拷贝)。尤其是大数组作为参数或返回值,在速度要求高的场合下,额外的内存拷贝开销就不能忽视了。
-
python 库的方法接口可能跟其对应的 js 库的接口参数、返回值格式不一致,有一定的适配工作量。
五 总结
尽管有上述种种缺陷,得益于代码移植的高效率和逻辑上 1:1 复刻的高可靠性保障,我们还是可以把这种方法运用到多种业务场景里,为推动机器学习技术的应用添砖加瓦。
链接:
1、测试页面:
https://test-bucket-duplicate.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com/public/pyodide/test.html
2、文档:
https://pyodide.org/en/stable/usage/type-conversions.html
3、官方已编译包的列表:
https://github.com/pyodide/pyodide/tree/main/packages
4、手册:
https://emscripten.org/docs/api\_reference/Filesystem-API.html